食品廠車間凈化工程完工后，不是直接投入使用的。而是需要經過一系列的測試，比如測量車間內粒子濃度或微生物濃度，以確定其達到了相關規定的標準。那么工程具體如何測試呢?
1.測量食品廠車間凈化工程送風量與排風量：如果是紊流車間，那就要測量其送風量與排風量。若為單向流車間，則要測量其風速。
2.食品廠車間凈化工程各區之間的氣流控制：為證明各區之間氣流的運動方向正確，也就是從潔凈區向潔凈度差的區域流動，必須檢測：各區間的壓差正確;無塵車間門口處或墻、地板等處的開口處氣流運動方向正確，即從潔凈區向潔凈程度差的區域流動。
3.對食品廠車間凈化工程過濾器檢漏：對高效過濾器及其外框要進行檢驗，以保證懸浮污染物不會穿過;檢查是否存在損壞了的過濾器;檢驗過濾器裝置的其他部位而防止污染物侵入車間內。
4.食品廠車間凈化工程隔離檢漏：是為了測試懸浮污染物不穿過建筑材料侵入無塵車間。
5.測試食品廠車間凈化工程內氣流控制：氣流控制測試依氣流模式——是紊流還是單向流而定。若車間氣流為紊流，則必須驗明室內沒有氣流運行不足的區域。若是單向流，則必須驗明整個無塵車間內的風速和風向是符合設計要求的。
6.對食品廠車間凈化工程懸浮粒子濃度和微生物濃度的測試：上述測試滿足要求后，最后對粒子濃度和微生物濃度(必要時)進行測量，以便驗明其符合無塵車間設計的技術條件。
除了前面提到的污染控制方面的測試以外,食品廠車間凈化工程有時還必須進行若干項測試：例如溫度、相對濕度、室內加熱與冷卻容量、噪聲值、光照度、振動值等。